Okulumuz 1965-1966 öğretim yılında Alpu Ortaokulu olarak öğretime başlamıştır.1965-1966 öğretim yılı sonunda ilkokul binasının yetersiz olması, ortaokul binasının geniş olması nedeniyle ilkokul ve ortaokul binaları "İl Onayı " ile yer değiştirmiştir.1976 yılına kadar binamız ilkokul olarak hizmet vermiştir.1976 yılında ortaokul kendi binamıza taşınmıştır.

1978-1979 Öğretim yılında ortaokulu bünyesine alan Alpu Lisesi açılmıştır. Alpu Lisesi 1997-1998 öğretim yılına kadar kendi binasında hizmet vermiştir. Zorunlu 8 yıllık İlköğretimin yürürlüğe girmesiyle "İl İzleme ve İcra Kurulu" lise bünyesindeki ortaokulun aynı binada kalması, lisenin ilkokul binasına taşınması, ilkokulun da ortaokul binasına taşınması ve ilköğretim okuluna dönüştürülmesine karar vermiştir. Yeni İlköğretim binasının yapılmasıyla Lise 2006-2007 Öğretim yılının başında halen öğretim yaptığı kendi binasına taşınmıştır.